La cave de fermentation est officiellement mise en route quand le professeur Itsuki et sa petite troupe commencent à produire du miso et de la sauce soja. Entre luttes féodales et Vietnam, les microbes sont sur le pied de guerre !
C’est alors qu’Oikawa découvre un mystérieux réseau de passages souterrains dans les sous-sols de l’université. Soupçonnant le professeur de mener des expériences dangereuses dans d’anciennes installations militaires, elle envoie Sawaki enquêter sur ce mystère…