Après leur traversée des souterrains, Shion et Nezumi parviennent à pénétrer dans l'enceinte de la prison. Leur objectif : délivrer Safu, retenue au tout dernier étage de l'établissement de haute sécurité. Mais les obstacles continuent de s'accumuler sur leur passage, obligeant Shion à agir de façon irréversible. Alors que le chaos s'empare de la ville, les deux jeunes gens découvrent ainsi le funeste projet ourdi par les autorités de N°6...