En l'an 2019, le lieutenant Motoko Kusanagi est chef d'une escadre de police spécialisée dans la lutte contre la cyber-criminalité. Dans un monde où l'homme a troqué des parties de son corps contre des organes synthétiques et où désormais rien ne le distingue de la machine, Kusanagi, dont le corps sculptural créé de toutes pièces ne lui appartient même pas, s'interroge peu à peu sur la conscience qui l'habite, son « Ghost ». Femme d'action, elle mène son équipe avec professionnalisme et résout complot sur complot. Mais au-delà de ses missions périlleuses, elle pourrait bien être le « complément » d'une nouvelle forme de vie issue de l'amas d'informations du Net...

Publié dans « Young Magazine » dès 1991, Ghost in the Shell est sans doute l'oeuvre la plus aboutie de Shirow. Le manga a fait l'objet d'une adaptation en film d'animation par le maître Mamoru Oshii en 1995, film salué par la critique comme une nouvelle référence dans le genre. Ghost in the Shell pose des questions essentielles sur la nature du vivant et la valeur de la virtualité, jusqu'à inspirer des oeuvres comme « Matrix ». En France, les nombreux fans de cette série attendaient en trépignant d'impatience la parution du troisième volume ; c'est maintenant chose faite.