Durant des millénaires, les chevaliers Jedi ont fait régner l'ordre et la justice au sein de la galaxie. Depuis quelques mois, cependant, leur rôle n'est plus seulement d'assurer la stabilité de la République mais de défendre son existence même, face aux forces séparatistes qui menacent de la faire éclater. De leur vaillance mais aussi de leur sens stratégique dépendra l'issue de cette guerre sans précédent : la Guerre des Clones. Le sénateur Palpatine, alias Dark Sidious, et les séparatistes sont parvenus à leurs fins : exterminer l'ordre des chevaliers Jedi grâce à l'armée des Clones et préparer l'avènement d'un Empire. Au coeur de la tourmente, les Jedi fugitifs se regroupent contre un nouvel ennemi : Dark Vador, le bras droit de Palpatine. Parmi eux, Quinlan Vos et ses compagnons doivent survivre par tous les moyens s'ils veulent sauver ce qu'il reste de la République.