L'arrivée de Smith et de ses compagnons sur l'île ne doit absolument rien au hasard. À l'origine de ces événements, un homme, Nemo. Pourquoi toutes ces manoeuvres de la part de l'illustre capitaine ? Pourquoi s'acharnet- il à remettre en service le Nautilus ? Quel est ce passé trouble qui semble le hanter ? Les cinq amis ne tarderont pas à le savoir, en tombant aux mains d'étranges pirates thugs...