Jonathan Joestar est mort durant son combat contre Dio. Le jeune Joseph, son petitfils, qui maîtrise l'onde depuis son plus jeune âge, se rend au Mexique à la recherche de l'assassin de Speedwagon. Il tombe sur l'armée nazi qui vient de réveiller un être puissant, immortel et terriblement dangereux. Joseph va vite se rendre compte que ce monstre n'est pas tout seul.