Les X-Men luttent pour que le rêve du professeur Xavier devienne réalité : voir un jour humains et mutants vivre ensemble, dans la paix et l'harmonie. Mais tous ne sont pas de cet avis et un vent de révolte souffle parmi les élèves pour jeunes Surdoués... Après cela, l'équipe devra arrêter Magnéto qui lance une attaque d'envergure contre New York.