Armé de l'épée Judecca, Arata affronte le Maô Trinity Abysse. Mais alors que le jeune homme croit sa victoire assurée, son adversaire se sert de Lilith pour ouvrir une porte sur un autre monde et récupérer la totalité de ses pouvoirs. Débute alors une bataille aux dimensions épiques qui fait trembler la bibliothèque flottante.